Отделение детской урологии было организовано и открыто 22.12.1970 года. На сегодняшний день оно является единственным узкоспециализированным, высококвалифицированным отделением в области по данному профилю. Круглосуточно оказывается экстренная помощь. В отделении выполняется весь объём плановой хирургической помощи (урологической): реконструктивные операции по поводу врожденных пороков развития мочевыделительной системы, генитальная хирургия у мальчиков, операции по коррекции нарушения формирования пола у девочек и мальчиков и т. д. Экстренная помощь оказывается круглосуточно. Плановая - ежедневно, кроме субботы и воскресенья. Плановая консультативная помощь оказывается на базе поликлиники педиатрического корпуса (как по ОМС, так и по платным услугам).